Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vamp4O70480 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vamp4O70480 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms