Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52l1O54818 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpd52l1O54818 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpd52l1O54818 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpd52l1O54818 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpd52l1O54818 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpd52l1O54818 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpd52l1O54818 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpd52l1O54818 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms