Protein–RNA interactions for Protein: O35949

Elovl3, Elongation of very long chain fatty acids protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elovl3O35949 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Elovl3O35949 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Elovl3O35949 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Elovl3O35949 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Elovl3O35949 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Elovl3O35949 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Elovl3O35949 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms