Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1baO35930 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1baO35930 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms