Protein–RNA interactions for Protein: O35709

Enc1, Ectoderm-neural cortex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Enc1O35709 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Enc1O35709 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Enc1O35709 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Enc1O35709 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Enc1O35709 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Enc1O35709 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Enc1O35709 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Enc1O35709 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Enc1O35709 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Enc1O35709 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms