Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxd2O35392 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxd2O35392 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxd2O35392 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Foxd2O35392 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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