Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nedd9O35177 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nedd9O35177 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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