Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcns1O35173 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcns1O35173 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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