Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarb2O35114 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarb2O35114 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Scarb2O35114 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scarb2O35114 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms