Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgisO35074 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgisO35074 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgisO35074 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtgisO35074 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgisO35074 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtgisO35074 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtgisO35074 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtgisO35074 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtgisO35074 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgisO35074 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgisO35074 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtgisO35074 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtgisO35074 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms