Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 339.2 ms