Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6871L7N248 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6871L7N248 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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