Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3099J3QPA5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3099J3QPA5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3099J3QPA5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3099J3QPA5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3099J3QPA5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3099J3QPA5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms