Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
2210016F16RikG3X8U3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
2210016F16RikG3X8U3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms