Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h7bF8VPP8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h7bF8VPP8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms