Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20518E9Q548 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms