Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms