Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930426L09RikE9Q0N7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930426L09RikE9Q0N7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930426L09RikE9Q0N7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930426L09RikE9Q0N7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
4930426L09RikE9Q0N7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930426L09RikE9Q0N7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930426L09RikE9Q0N7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930426L09RikE9Q0N7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930426L09RikE9Q0N7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms