Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm20425E9Q035 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm20425E9Q035 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms