Protein–RNA interactions for Protein: E9PVR6

Vmn1r1, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r1E9PVR6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r1E9PVR6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r1E9PVR6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r1E9PVR6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms