Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc17E9PVB5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc17E9PVB5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms