Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc13D3YV10 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc13D3YV10 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc13D3YV10 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms