Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CatipB9EKE5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CatipB9EKE5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms