Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11bB4XVQ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Phf11bB4XVQ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Phf11bB4XVQ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Phf11bB4XVQ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Phf11bB4XVQ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Phf11bB4XVQ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Phf11bB4XVQ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Phf11bB4XVQ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Phf11bB4XVQ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Phf11bB4XVQ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Phf11bB4XVQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms