Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cyp26c1B2RXA7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp26c1B2RXA7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms