Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrn3B2RS91 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrn3B2RS91 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrn3B2RS91 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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