Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Otud4B2RRE7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Otud4B2RRE7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Otud4B2RRE7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otud4B2RRE7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Otud4B2RRE7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms