Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdc27A2A6Q5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc27A2A6Q5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms