Protein–RNA interactions for Protein: A2A591

Krtap3-1, Keratin-associated protein 3-1, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap3-1A2A591 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap3-1A2A591 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap3-1A2A591 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms