Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pkd2l1A2A259 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l1A2A259 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms