Protein–RNA interactions for Protein: A1A535

Veph1, Ventricular zone-expressed PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Veph1A1A535 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Veph1A1A535 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Veph1A1A535 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Veph1A1A535 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms