Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ino80eA0A0U1RP99 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms