Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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