Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc166S4R181 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ccdc166S4R181 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc166S4R181 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms