Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C8

Htr6, 5-hydroxytryptamine receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr6Q9R1C8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr6Q9R1C8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr6Q9R1C8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr6Q9R1C8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr6Q9R1C8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr6Q9R1C8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htr6Q9R1C8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms