Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndrg3Q9QYF9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndrg3Q9QYF9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms