Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms