Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irx4Q9QY61 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms