Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tcea2Q9QVN7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms