Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfr2Q9JKX3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfr2Q9JKX3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfr2Q9JKX3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfr2Q9JKX3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfr2Q9JKX3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfr2Q9JKX3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfr2Q9JKX3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.4 ms