Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmx1aQ9JKU8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmx1aQ9JKU8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms