Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scube2Q9JJS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scube2Q9JJS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scube2Q9JJS0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms