Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc12a4Q9JIS8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Slc12a4Q9JIS8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms