Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Cldn19Q9ET38 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Cldn19Q9ET38 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Cldn19Q9ET38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn19Q9ET38 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Cldn19Q9ET38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn19Q9ET38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn19Q9ET38 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn19Q9ET38 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn19Q9ET38 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn19Q9ET38 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn19Q9ET38 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn19Q9ET38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn19Q9ET38 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn19Q9ET38 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn19Q9ET38 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms