Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pak1ip1Q9DCE5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pak1ip1Q9DCE5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pak1ip1Q9DCE5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms