Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne8Q9DC53 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne8Q9DC53 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms