Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cbx6Q9DBY5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cbx6Q9DBY5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms