Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prpf4Q9DAW6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms