Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3bQ9DA80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms