Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sgf29Q9DA08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sgf29Q9DA08 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 765.6 ms